A jornada científica é o maior evento acadêmico institucional, que tem como objetivo oportunizar a participação de todos os discentes em evento técnico-científico com apresentação de trabalho, com momentos artísticos e culturais.
Dentro da Jornada científica acontecem simultaneamente vários eventos: Conic, Seminário de Extensão (Semex), Seminário do Pibid (Programa de Iniciação à Docência), II SEPÓS - Seminário de Pós- Graduação, o ERAU (Encontro de representantes acadêmicos da unemat), Seminário FOCCO (Formação de Células Cooperativas de Aprendizagem) e o Seminário de Residência Pedagógica, o evento abrange os 13 campi da instituição, a FAINDI e os cursos de pós graduação.
A Jornada Científica é um evento que reúne no mesmo espaço as pró-reitorias, pesquisadores e acadêmicos interessados em discutir o ensino, a pesquisa e a extensão de forma indissociável. A Jornada contou com 8 edições, sendo a última realizada em 2017 em Cuiabá.
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