A área temática de Direitos Humanos e Justiça atua junto à assuntos relacionados à assistência jurídica, capacitação e qualificação de recursos humanos e de gestores de políticas públicas de direitos humanos, direitos de grupos sociais; diversidade; hipossuficientes, organizações populares, questão agrária e cooperação interinstitucional na área.
Na Unemat a gestão desta área temática é realizada por meio da Diretoria de Gestão de Direitos Humanos, Justiça e Meio Ambiente. A Diretoria incentiva a realização de atividades de extensão, ensino e pesquisa em um viés humanitário, promovendo uma interação dialógica que oriente o desenvolvimento das relações entre a Universidade e os setores sociais, superando o discurso da hegemonia acadêmica.